PhD MRI right ventricular and lung physiology in pulmonary hypertension

Intro

Wil je je klinische en technische vaardigheden inzetten om de gezondheidszorg te verbeteren? In deze rol werk je met MRI-technologie en gegevensverwerking om algoritmes te ontwikkelen die de energieoverdracht in de rechterventrikel modelleren. Programmeerervaring is vereist.

Wat ga je doen?

Je werkt in een multidisciplinair team en werkt samen met zorgprofessionals en MRI-fysici om geavanceerde beeldvormingstechnieken te ontwikkelen en klinisch te valideren.

Je zult:

• 4D flow MRI-data gebruiken die in een klinische setting zijn verkregen om segmentaties te ontwerpen, met behulp van AI en/of handmatig. Er zijn workflows beschikbaar, maar deze moeten aangepast worden aan de toepassing, evenals protocollen voor kwantificatie van de berekeningen;
• Algoritmen ontwerpen om de energiedynamiek in de rechterventrikel en het hart te berekenen, in termen van kinetische energie en viskeuze energieverliezen;
• Andere hemodynamische eigenschappen berekenen, zoals wandafschuifspanning (wall shear stress), wervelvorming en vortexdetectie, en stroomcomponenten in de rechterventrikel en andere hartcompartimenten;
• Long-MRI-sequenties verzamelen (zoals 3D Preful) om te testen bij vrijwilligers en later bij patiënten;
• Deelnemen, indien toegekend, aan een project om het effect van Xenon-gas op rode bloedcellen te meten, met als doel het meten van pulmonale oxygenatie bij gezonde en zieke patiënten;
• Bachelor en master studenten begeleiden die helpen met het project en kennis maken met onderwijs activiteiten.

Wat neem je mee?

Wij zijn op zoek naar een PhD-student met:

• Een MSc-diploma in Technische Geneeskunde, Biomedical Engineering of een vergelijkbare studie (vermeld je gemiddelde cijfer en de meest relevante vakken);
• Een interdisciplinaire instelling; open en proactief in de interactie met onderzoekers uit verschillende disciplines (bijv. zorgverleners, medisch onderzoekers en andere technische onderzoekers);
• Programmeerervaring (programmeervaardigheden in Matlab, Python en/of C++ zijn een pré)
• Vaardigheden in Engelse communicatie, presentatie en schrijven.

Wat bieden we jou?

• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk.
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven.
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld.
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor de duur van 12 maanden, met de intentie te verlengen tot een totaal van 4 jaar. Voor deze vacature geldt de Richtlijn Promovendi.
• Inschaling in salarisschaal OIO: € 3.017 tot € 3.824 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%. Bereken hier jouw netto salaris. Vanaf 1 juli 2025 is er een salarisverhoging van 3%. Zie hier meer informatie over de verbeterde arbeidsvoorwaarden.
• Vakantie-uren: 190,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis.
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV.

Waar ga je werken?

Je maakt deel uit van de MRI-fysica groep van Amsterdam UMC (locatie AMC) en de afdeling Longgeneeskunde. MR-fysicus Dr. Eric Schrauben en universitair hoofddocent Dr. ir. Pim van Ooij (Radiologie, locatie AMC) zullen de dagelijkse begeleiding verzorgen, terwijl prof. dr. Anton Vonk Noordegraaf van de afdeling Longgeneeskunde en Lillian Meijboom van de afdeling Radiologie (locatie VUmc) de klinische en fysiologische aspecten superviseren. MRI-acquisities zullen samen met MR-fysicus Dr. Tim Marcus worden uitgevoerd op locatie VUmc. De MRI-fysica onderzoeksgroep biedt een bronrijke en stimulerende wetenschappelijke omgeving.

Wij zijn een energiek en enthousiast team van ongeveer 15 PhD-kandidaten, 3 postdocs, 5 assistent-professoren en twee professoren. De MRI-fysica groep maakt deel uit van de afdeling Radiologie en Nucleaire Geneeskunde. De Longziekten onderzoeksgroep is even energiek en enthousiast, met een vergelijkbaar aantal leden.

Wat ga je onderzoeken?

Om rechterhartfalen (RV-falen) bij pulmonale hypertensie (PH) beter te begrijpen, is een nauwkeurige beoordeling van de RV-functie op basis van arbeid, energie en vermogen cruciaal. Huidige methoden, zoals invasieve druk-volume-lussen, missen ruimtelijke resolutie en zijn vaak onnauwkeurig door RV-dyssynchronie en tricuspidalisklepinsufficiëntie.

Dit project ontwikkelt een nauwkeurigere functionele beschrijving van de RV met behulp van 4D flow MRI, waarmee bloedstroom in drie richtingen over de tijd wordt gemeten. In combinatie met anatomische beelden kunnen biomarkers zoals kinetische energie, energieverlies, drukgradiënten en hemodynamische krachten worden bepaald. Deze methode biedt een completer beeld dan druk-volume-lussen.

We passen deze techniek toe bij PH-patiënten vóór en na behandeling met het nieuwe medicijn sotatercept. Daarnaast onderzoeken we de fysiologie in de longen met geavanceerde MRI-technieken zoals 3D-perfusie, bSSFP, contrastversterkte beeldvorming en mogelijk ¹²?Xenon-MRI gasuitwisseling.

Wil je alvast meer weten over de verschillende fases binnen het PhD traject? Op deze pagina lees je hierover meer informatie. 

Sollicitaties worden doorlopend in behandeling genomen, indien er een geschikte kandidaat gevonden is, wordt de vacature vroegtijdig gesloten.

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie over deze vacature kun je terecht bij Dr. ir. Pim van Ooij, via p.vanooij@amsterdamumc.nl.

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je terecht bij Chey Edwards, recruitment adviseur, via c.i.edwards@amsterdamumc.nl. 

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Bekijk wat het inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is. 

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.